Até 2019 o e-Docs fornecia um link externo para unificar diversos arquivos PDFs em um único arquivo.

Todavia, por questões de segurança da informação, a Secretaria de Controle e Transparência - SECONT orientou que sejam utilizados softwares fechados em vez de utilizar links públicos para fazer a unificação de PDFs.

Uma sugestão que atende a solicitação da SECONT é o software livre PDF SAM.
Esse software pode ser baixado e instalado no computador.
Segue o link abaixo:
PDF SaM

Uma outra sugestão é verificar com o seu setor de informática do órgão por uma outra solução.